Vergleich des Zervix- und Vaginalmikrobioms bei Dysplasiepatientinnen und Gegenüberstellung zweier Analyseverfahren in der Mikrobiomdiagnostik

Abstract

Das Zusammenspiel des zervikovaginalen Mikrobioms mit Immunantworten und sexuell übertragbaren Infektionen (STIs) ist für die Entwicklung gezielter diagnostischer und therapeutischer Strategien von großer Bedeutung. Ziel dieser Studie war es, die Eignung einer partiellen 16S-rRNA-Amplikonsequenzierung zur Detektion häufiger STI-Erreger zu untersuchen und mögliche Unterschiede zwischen vaginalen und zervikalen Abstrichen zu evaluieren. Hierzu wurden zwischen November 2021 und Februar 2022 am Universitätsklinikum Bonn bei Frauen mit auffälligem PAP-Abstrich oder positivem Hochrisiko-HPV-Nachweis im Rahmen einer Kolposkopie vaginale und zervikale Proben gewonnen. Die Mikrobiomanalyse erfolgte mittels 16S-rRNA-Sequenzierung der V1–V2- und V4-Regionen; der Nachweis von sechs häufigen STI-Erregern wurde mittels PCR durchgeführt. Hinsichtlich der bakteriellen Taxazusammensetzung und Diversität zeigten sich keine signifikanten Unterschiede zwischen vaginalen und zervikalen Proben. Die Sequenzierung der V1–V2-Region ermöglichte die Identifikation von etwa einem Drittel bis der Hälfte der PCR-positiven Proben, wobei die Nachweiswahrscheinlichkeit bei niedrigeren Ct-Werten zunahm. Die V4-Sequenzierung zeigte eine geringere diagnostische Leistungsfähigkeit mit weniger Identifikationen auf Speziesebene und einem höheren Anteil nicht eindeutig zuordenbarer Taxa. Die hohe Übereinstimmung des vaginalen und zervikalen Mikrobioms unterstreicht die Eignung vaginaler Abstriche als zuverlässige Alternative zu zervikalen Proben. Demgegenüber weist die partielle 16S-rRNA-Sequenzierung eine unzureichende Sensitivität für die zuverlässige STI-Diagnostik auf, insbesondere bei höheren Ct-Werten.