Proteomische Funktionsanalyse humanbiologischer Systeme mittels chemisch modifizierter Proteine

Abstract

Das humane Proteom unterliegt gegenüber dem eher statischen Genom einem kontinuierlichen Auf- und Abbau. Diese Dynamik zeigt sich durch ein mehrschichtiges Muster an Protein-Protein Interaktionen.<br /> Im ersten Teil dieser Arbeit wurde ein Pulldown-Protokoll etabliert, welches mit einer anschließenden Analyse mittels Proteomics zur Identifizierung von proteinspezifischen Protein-Protein Interaktionen angewendet wurde.<br /> Mittels dieses Pulldown Protokolls wurden in oralen Tumorzellen die Interaktionspartner humaner α- und β-Defensine ermittelt. Auf genomischer Ebene wurde in mehreren Studien festgestellten, dass die Defensine spezifische Einflüsse auf das Proliferationsverhalten der Zellen haben. Diese Auswirkung konnte auch auf proteomischer Ebene durch die Detektion charakteristischer Protein-Protein Interaktionen belegt werden.<br /> In einem weiteren Teil dieser Arbeit wurden mit dem im ersten Teil der Arbeit etablierten Protokoll die Protein-Bindungspartner von allergieauslösenden Allergenen in primären humanen Monocyten von allergenspezifischen Allergikern und Nichtallergikern ermittelt.

<strong>Proteomic functional analysis of human biological systems by chemically modified proteins</strong><br /> In contrast to the relatively static genome, the human proteome is characterized by continuous synthesis and degradation. These dynamics are reflected in the multilayered pattern of protein-protein interactions.<br /> In the first part of this work a pulldown protocol was established and combined with subsequent proteomic analyses to identify protein-specific protein-protein interactions.<br /> By means of this protocol the interaction partners of human α- and β-defensins in oral tumor cells were determined. Several studys have shown that defensins have specific effects on the proliferation behavior of these cells at the genomic level. These effects could be supported and elucidated on the proteomic level by the detection of characteristic protein-protein interactions.<br /> In a further part of this work this methodology was used to identify the protein binding partners of allergenic allergens in primary human monocytes of allergen-specific allergic and non-allergic systems.